上海民航職業技術學院始源于1980年在民航上海管理局教導隊基礎上成立的民航上海管理局技工學校。
1985年經上海市批準,在民航上海管理局技工學?;A上成立民航上海中等專業學校,隸屬于中國民用航空局,同時保留技工學校(該技工學校于1998年停辦)。
2002年,民航上海中等專業學校作為上海交通職業技術學院南校區,開始了為期11年的大專層次學歷教育。
2012年5月,在民航上海中等專業學?;A上成立上海民航職業技術學院。學院是一所面向行業,致力于培養具有大專學歷層次、培養服務于民航和社會發展所需的一線高素質、高技能型人才的高職院校。