石河子大學長期以來高度重視畢業生就業工作。一是切實執行就業工作“一把手工程”，形成了校、院、系三級就業指導服務體系；二是對大學生實施全過程就業指導，開設了《職業生涯規劃》、《溝通技巧》、《面試禮儀》、《就業心理輔導》等18個專題的就業指導課程；三是通過舉辦就業洽談會、就業實習等與疆內外金融、石化、醫療、教育、部隊等系統建立了順暢的人才輸送渠道；四是認真落實畢業生學費和國家助學貸款代償政策，凡到中西部地區和艱苦邊遠地區基層單位就業、服務期在3年以上（含3年）的，其學費由國家實行代償；五是學校對到新疆基層就業的本科畢業生，每生獎勵2000元。通過以上工作的開展，石河子大學就業工作取得了較好成績，自2002年以來連續八年本科就業率均在90%以上，位于新疆高校前列。2009年，學校被國家教育部評為50所全國畢業生就業典型經驗高校。