上海行健職業學院的前身為上海市閘北區業余大學，創建于1982年11月。1985年7月，上海市閘北區干部文化學校并入。1993年9月，閘北區第三職業技術學校并入。1998年9月，經上海市教育委員會批準，閘北區業余大學與閘北區職工中等專業學校的教育資源進行優化組合，建立閘北區社區學院。同年，閘北區第三職業技術學校與閘北區業余大學脫鉤。2000年1月，上海市教育委員會同意閘北區社區學院更名為上海行健學院。2001年4月，由閘北區人民政府申報，上海市人民政府審核批準，上海市閘北區業余大學轉型為高等職業學校，校名全稱為“上海行健職業學院”，同時停止使用“上海市閘北區業余大學”和“上海行健學院”校名。2001年9月，上海市工商職業技術學校（閘北區第二職業技術學院）并入。2003年9月，閘北區第二職業技術學校與上海行健職業學院脫離。