南京海員訓練班到南京海運學校（1951.1-1990.4）

1949年9月，原國民黨招商局“海遼”號等18艘海輪相繼起義；

1950年12月，中央人民政府交通部和中國海員總工會決定創辦南京海員訓練班，騰出南京白下路復興巷內斛斗巷19號，把原國民政府新建還未完工的立法院立法委員宿舍，作為創辦訓練班的校址。

1951年1月，南京海員訓練班正式開學，成為新中國最早的海員學校。中央政府為發展新中國航海事業，成立了新中國第一所船員培養專門學校——南京海員訓練班，初期學員為700多名起義船員，“重慶”艦起義官兵擔任教員。

1953年1月，海員培訓班改建為中國海員干部學校。

1955年，交通部決定在海員干部學校的基礎上籌辦海員專業技術學校，改名為南京初級航海學校。

1957年9月，經交通部海運總局與勞動部研究確定，學校為技工性質，培養目標為普通船員，改名為南京海運工人技術學校，劃歸交通部上海海運局領導。

1960年1月，交通部決定將學校改為中專，命名為交通部上海海運管理局南京海運學校。

1964年8月，隨著我國遠洋運輸船隊的建立與發展，航運企業對遠洋船員的迫切需求，經交通部決定，學校劃歸交通部遠洋運輸局領導，改名為南京遠洋技工學校。

1965年9月，又改名為南京遠洋海員學校，成為遠洋運輸局第一所直屬學校。

1973年3月，鑒于遠洋運輸事業的迅速發展，國家急需培養大量船員，交通部下達了《關于恢復南京遠洋海員學校的通知》，學校改名南京海員學校。

1990年4月，交通部批準“南京海員學校”恢復原“南京海運學校”校名。

南京河運工人技術學校到南京航運學校（1956.2-1992）

1956年2月，依照中央交通部河運總局指示，按照海運、河運人才培養計劃，在南京下關唐山路126號，籌建一所以培養內河輪駁駕駛方面的初級技術人才為目標的新學校——南京河運技工學校。

1958年4月，長江航務管理局決定武漢技校和南京技校合并，學校由中技升格為中專。此為學校第一次的并校。

1959年2月，長江航務管理局通知改校名為“長江航運管理局南京航運學校”。 

1959年5月，長江航務管理局確定校名更換為“南京長江航運學校”。

1961年下半年，金陵船廠技校并入本校，此為學校第二次并校。