學院的前身是1923年由美國文化人士開辦的教會職業學校中華三育研究社和1946年由當時南京政府建立的江陰農校，1951年兩校在橋頭鎮合并創建為江蘇省句容農業學校。其后，上海高行農校、江蘇省南通農校、江蘇省淮陰農校的畜牧獸醫專業師生并入句容農校，學校得到了長足發展，成為聞名省內外的一所名校。

六十年代，由于“文革”的影響，學校于1969年被迫停辦。

1975年鎮江地區在現校址創辦了“五•七”農業大學

1981年經省政府批準在“五•七”農大的基礎上恢復了江蘇省句容農業學校， 2000年5月被國家教育部批準為國家級重點中專校

2001年8月經省政府批準更名為江蘇省農林學校

2002年6月，經省政府批準，成立了江蘇農林職業技術學院，隸屬于江蘇省農林廳,同時接受省教育廳的領導