國家實驗室：

清華信息科學與技術國家實驗室?

國家重點實驗室：

摩擦學國家重點實驗室

電力系統及大型發電設備安全控制和仿真國家重點實驗室

微波與數字通信技術國家重點實驗室

新型陶瓷與精細工藝國家重點實驗室

環境模擬與污染控制聯合國家重點實驗室(清華分室)

精密測試技術及儀器國家重點實驗室

化學工程聯合國家重點實驗室(萃取分離分室)

集成光電子學聯合國家重點實驗室(清華大學實驗區)

智能技術與系統國家重點實驗室

生物膜與膜生物工程國家重點實驗室(膜生物物理分室)

汽車安全與節能國家重點實驗室

北京（國家）電子顯微鏡中心

教育部重點實驗室：

先進材料教育部重點實驗室

破壞力學國家教育部重點室

生命有機磷及化學生物學教育部重點實驗室

單原子分子測控教育部重點實驗室

量子信息與測量教育部重點實驗室

水沙科學教育部重點實驗室

傳熱強化與過程節能教育部重點實驗室

生物信息學教育部重點實驗室

結構工程與振動教育部重點實驗室

先進反應堆工程與安全教育部重點實驗室

普適計算機教育部重點實驗室

有機光電子及分子工程教育部重點實驗室

蛋白質科學教育部重點實驗室

先進成形制造教育部重點實驗室

國家工程研究中心：

國家計算機集成制造系統(CIMS)工程研究中心

光盤系統及應用技術國家工程研究中心

工業鍋爐及民用煤清潔燃燒國家工程研究中心

國家企業信息化應用支撐軟件工程技術研究中心

生物芯片北京國家工程研究中心